由于沙棘果皮薄，水分多，只要储存方法不对或是在常温环境中放置时间过久，沙棘果就会出现老化褐变、以及因感染微生物而造成的腐烂、变味等现象。

因为，沙棘果从树上采收下来，会带有大量的“田间热”，若不进行预冷处理就会造成萎蔫、发黄、变质等情况。黑龙江沙棘果厂家建议预冷温度控制在5~8℃。

然后保存方法就是速冻。速冻沙棘果能基本上保持沙棘果原有的自然形状和风味;在贮藏期间其色、香、味和维生素没有显著变化，这样的保存方法效果理想。

在挑选沙棘的时候，要选择沙棘果实类球形或扁球形，单个或数个粘连，单个直径5-8mm;表面棕红色或黑褐色，皱缩，多具短小果柄，这样的沙棘是比较优质的，同时优质的沙棘果肉油润，质柔软。种子扁卵形，长2.5-4mm，宽约2mm，表面褐色，种脐位于狭端，另一端有珠孔，两侧各有一条纵沟;种皮较硬，击破后，子叶乳白色，油性。气微，味酸、涩，这种沙棘反而是非常健康度。所以总的来说，沙棘果实以粒大、肉厚、油润的是好的。

沙棘果实贮藏的条件要求非常严格。刚采收的沙棘果实如暂时不能出售，必须进行短时间的贮藏。贮藏果实必须保持低温、通风和能排除有害气体的环境。贮藏的温度以1～5℃为宜，空气的相对湿度应保持在90％～95％。

如果是在结冰季节采收的果实，可用少量的水洒在堆积好的果实堆上，把果实封冻起来，再在果实堆上覆盖一层柴草，以保持其清洁。这个是造酒,酒劲不大时就成了饮料,但易保存。